博士辞职的处理通常遵循以下步骤和原则：
审查合同条款
检查与单位签订的劳动合同中是否有关于服务期、专项培训费用、保密义务或竞业限制的特别约定。
如果存在服务期协议，且您在服务期内辞职，可能需要按照协议支付违约金。
如果合同中有明确的辞职赔偿条款，且不违反法律法规，则按合同约定执行。
法定程序
根据《劳动合同法》，一般情况下，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位可以解除劳动合同。
若在试用期内，提前三日通知即可解除劳动合同。
赔偿情况
如果单位存在未按合同约定提供劳动条件、未及时足额支付劳动报酬等违法情形，辞职通常无需赔偿。
如果单位提供了专项培训费用，并且约定了服务期，在服务期未满时辞职，可能需要按比例赔偿培训费用。
若因单位过错（如未依法缴纳社保等）被迫辞职，通常也无需赔偿。
协商解决
与指导教师、实验室负责人或单位人事部门商议，以便优雅地处理辞职事宜。
工作交接
完成必要的交接手续，如最后一次实验室出勤记录、实验器材清算等。
可能的法律途径
如遇争议，可以通过申请劳动仲裁等合法途径解决。
请根据您的具体情况和相关证据来确定辞职时是否需要赔偿。