公司进行减员操作可以按照以下步骤进行：
登录社保网站
使用公司的账号登录当地社保网站。
在人员变更选项中选择“人员减少”。
选择需要减少的人员，并点击业务提交。这样减员即完成。
停保并提供证明文件
公司需要为员工停保，并打印人员减少表。
提供解除劳动合同证明书交给离职员工。
办理减员手续
可以携带单位的公章到所在的劳动保障部门办理减员手续，即中止社保手续。
用人单位增减员可使用纸质办理，所需资料包括：
《社会保险费明细申报表》一式二份。
减员需提供离职证明或解除劳动合同书原件及复印件。
增员需提供身份证、户口簿复印件，劳动合同书原件及复印件。
变动人数在5人以上的需提供上门增减员导盘文件。
提交纸质资料
用人单位在增、减员变动当月携带上述纸质资料到办税厅办理，并携带税务登记证副本以备核查。
网上申报
如果公司开通了网上申报社保费的服务，可以通过省网报税系统在网上操作减员及申报缴纳社保费。
具体操作指引可登录广东省地方税务局网站首页>>>办税服务>>>资料下载>>>操作手册--广东地税网上办税系统操作手册查看。
注意事项
如果员工在当月应减员，应在每月1-15日申报当月社保费前办理当月减员申请。
如果如期后不能申请减员，则需在下月办理。
如属于未及时办理减员的情况，下月可办理退费。
通过以上步骤，公司可以顺利完成减员操作。建议提前准备好所有所需资料，并确保按照当地社保局的规定进行办理，以保证减员流程的顺利进行。