公交司机 属于公交公司，具体部门可能因公司结构和运营模式的不同而有所差异。在计划经济时期，公交公司可能属于市属事业单位，公交司机则有正式事业编制。然而，随着体制改革的进行，公交公司逐渐转变为国有控股的普通企业，公交司机也随之成为企业员工。
此外，公交公司一般由属地交通主管部门即交通运输局管理，许多城市交通运输局都成立了城市客运管理处，直接对口公交公司。因此，公交司机也可以视为交通运输管理部门的一部分，尽管他们可能不直接隶属于该部门。
综上所述，公交司机主要归属公交公司管理，部分情况下可能受交通运输局城市客运管理处的管理与指导。