回迁协议丢失了，可以通过以下方式处理：
找到原始协议单位并复印
如果回迁协议丢失，可以尝试找到原始的协议单位，请求他们提供一份复印件，并加盖公章以确认其与原件具有同等法律效力。
向政府部门申请调取或复印
回迁协议通常在政府部门有备案，可以携带相关身份证明和回迁房屋的相关证明文件资料，到当地的拆迁办或房管局申请调取或复印。
补办申请证明和登报声明
如果协议丢失且无法找到原始文件，可以向相关部门提交补办申请，并提供必要的证明文件，如补发申请证明书、登报声明和具结书。
通过法律途径解决
如果相关部门不予配合，可以寻求法律帮助，向法院提起诉讼，要求确认回迁安置权利，并提供其他能够证明回迁安置权利的证据。
留存相关证据
在处理协议丢失和补办的过程中，注意留存所有的沟通记录、申请材料的副本等，以备不时之需。
建议尽快联系相关部门或拆迁人，说明情况并咨询具体的补办流程和要求，以确保能够顺利补办回迁协议。