查询民办非企业信息的方法如下：
网上政务服务平台
可以通过各个省、市的文件查询系统进行查询，例如在“北京市政务服务网”上可以查找民办非企业的相关信息。
政府部门网站
由民政部管理的民办非企业信息可以在民政部官方网站上查询。
各地民政部门网站也会有当地社会组织的相关信息公示，如广东省社会组织综合信息服务平台，可查询到包括基金会、民办非企业单位在内的社会组织的许可公示、募捐公示、年检公告、异常名录处罚公示等内容。
社会组织信息平台
例如，在深圳市，可以通过深圳市社会组织信息平台查看民办非企业的登记信息，网址为：http://sgj.mzj.sz.gov.cn:9008/information。
登记管理机关
向当地的登记管理机关查询，民政部门会在公开发行的报刊上发布公告，公告内容包括名称、住所、法定代表人或单位负责人、开办资金、宗旨和业务范围、业务主管单位、登记时间、登记证号等。民办非企业单位登记证书相当于企业的营业执照。
专业服务机构
可以借助专业的代理服务公司，如北京首税会计服务有限公司、北京经典世纪登记注册代理事务所等，他们可能有干净无异常的基金会或民非资源，并提供相关的尽职调查服务。
会计师事务所和律师事务所
聘请专业的会计师事务所对目标组织的财务状况进行审计，查看是否存在财务问题；律师事务所可以协助了解目标组织的法律状况。
建议您根据具体需求和方便性，选择以上一种或多种方法进行查询。